Không chỉ được biết đến là một cầu thủ tài năng trên sân cỏ, Mạc Hồng Quân từng gây chú ý bởi chuyện tình cảm, đời tư nhiều ồn ào. Vào năm 2015, Mạc Hồng Quân trở thành tâm điểm tranh cãi, bị chỉ trích thậm tệ giữa ồn ào phụ bạc ruồng bỏ bạn gái cũ Ly Kute - thời điểm cô đang mang bầu 4 tháng. Chỉ một thời gian ngắn sau đó, Mạc Hồng Quân công khai chuyện tình cảm và kết hôn với người mẫu Kỳ Hân. 

Tuy chuyện tình của cả hai gặp không ít những lời chỉ trích từ phía cộng đồng mạng và được dự báo là sẽ sớm tan vỡ vào thời điểm ấy. Nhưng cho đến nay, sau 4 năm chung sống dưới cùng một mái nhà và có thêm cậu con trai đầu lòng kháu khỉnh thì cả hai đã chứng minh cho mọi người thấy độ bền vững và hạnh phúc trong mối quan hệ của mình.

Mạc Hồng Quân kết hôn với người mẫu Kỳ Hân. 

Cuộc hôn nhân của Mạc Hồng Quân và Kỳ Hân cũng có "trái ngọt" là cậu con trai 4 tuổi - tên thân mật là Tỏi. 

Trên trang cá nhân, Mạc Hồng Quân chủ yếu chia sẻ về công việc và những hình ảnh bên cạnh vợ con. Anh thường xuyên đăng tải những khoảnh khắc vui vẻ, hạnh phúc bên gia đình. Những lúc khó khăn, Mạc Hồng Quân cũng không quên dành cho bà xã những lời động viên, khích lệ.

Thời gian này V.League 2020 thông báo tạm hoãn đến hết tháng 3 do ảnh hưởng của dịch COVID-19 chàng tiền đạo Việt kiều Mạc Hồng Quân đã có dịp tận hưởng không gian riêng với vợ sau khi đưa bé Tỏi (tên thật Mạc Xuân Phúc – con trai Mạc Hồng Quân và Kỳ Hân) sang Cộng hòa Czech thăm để ông bà nội.

Mạc Hồng Quân - Kỳ Hân có cuộc hôn nhân hạnh phúc, giản dị sau 5 năm kết hôn.