Trường hợp thứ nhất là bệnh nhi A.B.M (nam, SN 2015, trú tại xã Ea Yiêng, huyện Krông Pắk, tỉnh Đắk Lắk). 

Theo người nhà bệnh nhi, tối 16/11 bệnh nhi xuất hiện các triệu chứng sốt, ho khan, ở nhà chưa điều trị gì. Ngày 17/11, trẻ nôn ói, sốt cao liên tục, người nhà đưa trẻ đi khám và uống thuốc nhưng không đỡ. Đến tối 18/11, trẻ đi khám và điều trị tại Trung tâm Y tế huyện Krông Pắk. 

Ngày 19/12, trẻ được chuyển lên Bệnh viện Đa khoa vùng Tây Nguyên tiếp tục điều trị với chẩn đoán nhiễm trùng huyết, theo dõi viêm màng não, sốt xuất huyết Dengue ngày thứ 3. 

Ngày 08/12, bệnh nhi được tiếp tục điều trị với chẩn đoán suy hô hấp độ IV, nhiễm trùng huyết, viêm não màng não, phù não, xuất huyết tiêu hoá ổn. 

Kết quả xét nghiệm do Viện Vệ sinh Dịch tễ Tây Nguyên kết luận, bệnh nhi dương tính với bệnh viêm não Nhật Bản.

Trường hợp thứ 2 là bệnh nhi L.T.T (nữ, 3 tuổi, trú tại xã Cư Đrăm, huyện Krông Bông, tỉnh Đắk Lắk). Theo người nhà bệnh nhi, ngày 04/12 ở nhà trẻ xuất hiện triệu chứng sốt, ho, nôn ói khoảng 3 lần/ngày, ở nhà chưa điều trị gì. Ngày 06/12, người nhà đưa trẻ đi khám và điều trị tại Trung tâm Y tế huyện Krông Bông với chẩn đoán theo dõi viêm màng não. 

Ngày 07/12, trẻ được chuyển lên Bệnh viện Đa khoa vùng Tây Nguyên tiếp tục điều trị với chẩn đoán theo dõi viêm não màng não, theo dõi nhiễm trùng huyết. 

Ngày 12/12, trẻ tiếp tục được điều trị với chẩn đoán viêm não Nhật Bản, nhiễm trùng huyết. Kết quả xét nghiệm do Viện Vệ sinh Dịch tễ Tây Nguyên kết luận bệnh nhi dương tính với bệnh Viêm não Nhật Bản.

Quá trình điều tra véc tơ truyền bệnh lực lượng chức năng ghi nhận có sự hiện diện của muỗi Culex là véc tơ truyền bệnh viêm não Nhật bản B tại cả 2 khu vực, nơi 2 bệnh nhi sinh sống.